MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acinetobacter baumannii AYE plasmid p1ABAYE

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010401	AAAT	2	8	23	30	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010401	T	6	6	115	120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010401	ATT	2	6	210	215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010401	AT	3	6	243	248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010401	A	6	6	251	256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010401	TAA	2	6	326	331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010401	AAAT	2	8	342	349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010401	GCA	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010401	AAAT	2	8	534	541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010401	T	6	6	605	610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010401	TGAA	2	8	626	633	50 %	25 %	25 %	0 %	169302973
12	NC_010401	AAC	2	6	667	672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302973
13	NC_010401	A	6	6	726	731	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
14	NC_010401	CAA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302973
15	NC_010401	TGA	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302973
16	NC_010401	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
17	NC_010401	TAG	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302973
18	NC_010401	A	6	6	1043	1048	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
19	NC_010401	A	7	7	1066	1072	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
20	NC_010401	ACT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302973
21	NC_010401	A	8	8	1103	1110	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
22	NC_010401	A	6	6	1117	1122	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
23	NC_010401	A	6	6	1274	1279	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
24	NC_010401	TGT	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302973
25	NC_010401	GAAA	2	8	1312	1319	75 %	0 %	25 %	0 %	169302973
26	NC_010401	AG	3	6	1517	1522	50 %	0 %	50 %	0 %	169302973
27	NC_010401	ATT	2	6	1710	1715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302974
28	NC_010401	A	6	6	1734	1739	100 %	0 %	0 %	0 %	169302974
29	NC_010401	A	6	6	1767	1772	100 %	0 %	0 %	0 %	169302974
30	NC_010401	AGA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302974
31	NC_010401	GAT	2	6	1822	1827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302974
32	NC_010401	ATT	2	6	1864	1869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010401	TTTA	2	8	1873	1880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010401	A	7	7	1934	1940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010401	CCA	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010401	TAT	2	6	2025	2030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010401	CCA	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302975
38	NC_010401	TTA	2	6	2154	2159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302975
39	NC_010401	TATTAA	2	12	2197	2208	50 %	50 %	0 %	0 %	169302975
40	NC_010401	TA	3	6	2233	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	169302975
41	NC_010401	TCA	2	6	2337	2342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302975
42	NC_010401	TGC	2	6	2393	2398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302975
43	NC_010401	CTG	2	6	2413	2418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302975
44	NC_010401	TAA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302975
45	NC_010401	A	6	6	2545	2550	100 %	0 %	0 %	0 %	169302975
46	NC_010401	TAAAC	2	10	2632	2641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010401	CTAG	2	8	2804	2811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010401	GATA	2	8	2842	2849	50 %	25 %	25 %	0 %	169302976
49	NC_010401	TGA	2	6	2913	2918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302976
50	NC_010401	AAGAA	2	10	2940	2949	80 %	0 %	20 %	0 %	169302976
51	NC_010401	GTA	2	6	2962	2967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302976
52	NC_010401	AAT	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302976
53	NC_010401	AAAAC	2	10	3073	3082	80 %	0 %	0 %	20 %	169302976
54	NC_010401	AG	3	6	3085	3090	50 %	0 %	50 %	0 %	169302976
55	NC_010401	TTGA	2	8	3091	3098	25 %	50 %	25 %	0 %	169302976
56	NC_010401	AT	3	6	3145	3150	50 %	50 %	0 %	0 %	169302977
57	NC_010401	TGA	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302977
58	NC_010401	T	7	7	3391	3397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010401	ATCTTT	2	12	3459	3470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169302978
60	NC_010401	TTC	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302978
61	NC_010401	TCA	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302978
62	NC_010401	GTTT	2	8	3557	3564	0 %	75 %	25 %	0 %	169302978
63	NC_010401	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302978
64	NC_010401	T	7	7	3631	3637	0 %	100 %	0 %	0 %	169302978
65	NC_010401	AGC	2	6	3642	3647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302978
66	NC_010401	TTC	2	6	3684	3689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302978
67	NC_010401	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	169302978
68	NC_010401	ACCATC	2	12	3729	3740	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010401	TTGAA	2	10	3771	3780	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010401	CAAAA	2	10	3930	3939	80 %	0 %	0 %	20 %	169302979
71	NC_010401	AT	3	6	3945	3950	50 %	50 %	0 %	0 %	169302979
72	NC_010401	TAG	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302979
73	NC_010401	TGC	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302979
74	NC_010401	A	8	8	4067	4074	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
75	NC_010401	AAATAC	2	12	4109	4120	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169302979
76	NC_010401	CGAA	2	8	4166	4173	50 %	0 %	25 %	25 %	169302979
77	NC_010401	A	6	6	4278	4283	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
78	NC_010401	GCT	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302979
79	NC_010401	ACAG	2	8	4323	4330	50 %	0 %	25 %	25 %	169302979
80	NC_010401	TGA	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302979
81	NC_010401	CA	3	6	4357	4362	50 %	0 %	0 %	50 %	169302979
82	NC_010401	CAC	2	6	4370	4375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302979
83	NC_010401	A	7	7	4409	4415	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
84	NC_010401	GA	3	6	4463	4468	50 %	0 %	50 %	0 %	169302979
85	NC_010401	CAC	2	6	4491	4496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302979
86	NC_010401	TGA	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302979
87	NC_010401	ATG	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302979
88	NC_010401	A	6	6	4774	4779	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
89	NC_010401	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302979
90	NC_010401	AAC	2	6	4826	4831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302979
91	NC_010401	A	6	6	4872	4877	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
92	NC_010401	T	6	6	4887	4892	0 %	100 %	0 %	0 %	169302979
93	NC_010401	ATCA	2	8	4905	4912	50 %	25 %	0 %	25 %	169302979
94	NC_010401	CAACA	2	10	4932	4941	60 %	0 %	0 %	40 %	169302979
95	NC_010401	A	8	8	4987	4994	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
96	NC_010401	GA	3	6	4995	5000	50 %	0 %	50 %	0 %	169302979
97	NC_010401	TAAA	2	8	5014	5021	75 %	25 %	0 %	0 %	169302979
98	NC_010401	AGA	2	6	5027	5032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302979
99	NC_010401	GCT	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302979
100	NC_010401	CGAAC	2	10	5075	5084	40 %	0 %	20 %	40 %	169302979
101	NC_010401	AAC	2	6	5095	5100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302979
102	NC_010401	ATC	2	6	5131	5136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302979
103	NC_010401	TA	3	6	5214	5219	50 %	50 %	0 %	0 %	169302979
104	NC_010401	GAA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302979
105	NC_010401	AAAT	2	8	5240	5247	75 %	25 %	0 %	0 %	169302979
106	NC_010401	AGA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302979
107	NC_010401	A	8	8	5339	5346	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
108	NC_010401	GCA	2	6	5360	5365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302979
109	NC_010401	A	6	6	5377	5382	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
110	NC_010401	CAG	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302979
111	NC_010401	CAA	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302979
112	NC_010401	AAC	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302979
113	NC_010401	CAA	2	6	5487	5492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302979
114	NC_010401	CAAGAA	2	12	5517	5528	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169302979
115	NC_010401	CAG	2	6	5532	5537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302979
116	NC_010401	A	7	7	5609	5615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.